選擇“小三通”航線，可從福州、廈門、泉州出發(fā)，經(jīng)由金門、馬祖，再到臺灣本島，優(yōu)勢是班次多、出行靈活，每周經(jīng)由“廈門-金門”、“泉州-金門”、“馬尾-馬祖”航線的班次多達322個，其中“廈門-金門”252個航班、“泉州-金門”42班、“馬尾-馬祖”28班。廈金航線班次最密集，平均每22分鐘就有1班。此外，“小三通”還可將金門民俗文化村、莒光樓、延平郡王祠、八二三戰(zhàn)史館、翟山坑道、馬祖天后宮、北?？拥馈⒃婆_山等金門、馬祖景點，與臺灣本島旅游景點串聯(lián)起來。

游客也可選擇每周4個航班的廈門直航臺灣本島，從廈門港出發(fā)，乘坐高達8層、總噸位26847噸、載客683名的“中遠之星”滾裝船，直達臺灣基隆港、臺中港，價格較底，且夕發(fā)朝至，晚上睡一覺次日早上就到了。這是目前大陸與臺灣本島之間唯一常態(tài)化經(jīng)營的客運航線，而且福建正在加快建設(shè)第二條即平潭海上客運直航臺灣本島航線，“海峽號”客滾輪相關(guān)手續(xù)正在抓緊辦理，客運碼頭加快建設(shè)，力爭年內(nèi)投用。

除了海運之外，追求速度的游客可以選擇空中直航。目前，福建已開辟了從福州、廈門機場直飛臺灣高雄、臺中、桃園、松山等機場的8條航線，每周航班55個。